Я тут набрел на интереcный блог MySQL Performance Blog, посвященный оптимизации MySQL, в частности страница, на которой собраны все советы по оптимизации и настройке MySQL и различных его движков хранения.
Оттуда же: MySQL and PostgreSQL SpecJAppServer benchmark results -- сравнение производительности PgSQL и MySQL. Вывод: не настолько уж MySQL хорош, как принято думать, и для достижения превосходства над PgSQL нужно его хорошенько донастраивать от дефолтовой установки, ну и приложения должны быть подходящими, например, если вам нужны транзакции или подзапросы, то тут PgSQL однозначно будет лучшим выбором.